HLA-B27 is een erfelijke factor die bij 8 tot 10 procent van de bevolking voorkomt. Als de factoor in je bloed aanwezig is, heb je een verhoogde kans op een auto-immuunziekte, vooral op axiale spondyloartritis (ziekte van Bechterew) of uveïtis (oogontsteking). Ook kan HLA-B27 wijzen op onder andere psoriasis en de ziekte van Crohn. Bij sommige mensen komt HLA-B27 voor zonder dat er sprake is van een auto-immuunziekte. En omgekeerd komt niet bij iedereen die een auto-immuunziekte heeft, komt HLA-B27 voor.
Op basis van de HLA-B27 test is het dan ook niet mogelijk een definitieve diagnose te stellen.